El enfoque de la línea de moluscos se centra entre otras cosas, en la generación de conocimiento y de nuevas tecnologías para la producción consistente de semilla de moluscos, así como para los sistemas de engorda más eficientes a través de la conformación de pies de cría, la selección y el monitoreo ambiental de sitios de cultivo, la evaluación de las artes de engorda más propicias en determinados ambientes y el diagnóstico sanitario y de inocuidad alimentaria. Por otra parte, en cuanto a la generación de conocimiento, se trabaja constantemente en proyectos que se enfocan en estudios de metabolismo, inmunología, toxicología genética, epi-genética y fisiología, compuestos bioactivos altamente diluidos, entre otros, así como en la exploración del potencial de cultivo de otras especies de moluscos. Como parte del apoyo al sector social y productivo, la Línea de Moluscos trabaja de manera continua a través de convenios de colaboración orientados al fortalecimiento de la producción de moluscos nativos de la región y la validación de tecnologías para cultivo de bivalvo en zonas productoras en México.

La Línea Estratégica de Biología y Desarrollo de Tecnologías para el Cultivo de Crustáceos tiene como principal objetivo el generar conocimientos básicos y aplicados sobre la Biología de las especies de crustáceos en nuestro país y el desarrollo de tecnologías de cultivo innovadoras, dirigidas a apoyar y consolidar la camaronicultura en México. Asimismo, desarrollamos el cultivo de especies alternativas, tales como langostinos y otros crustáceos de agua dulce...

La línea de peces está conformada por 7 investigadores, 3 cátedras y 7 técnicos. El objetivo es desarrollar a escala piloto la tecnología para el cultivo de peces marinos y apoyar a las empresas y pequeños acuicultores a lograr la escala comercial. Se involucra las áreas de nutrición en larvas, juveniles y adultos (probióticos, enzimas digestivas, técnicas transcriptómicas y genómica funcional en diferenciación, crecimiento, salud y digestión), fisiología de la reproducción (manejo del ciclo de maduración, inducción hormonal y primera madurez,) patología con énfasis en inmunología, parasitología y patogénesis microbiana; genética (manejo de reproductores y estudios poblacionales). El uso de herramientas moleculares prácticamente en todos los temas. Actualmente se desarrolla la tecnología para el cultivo del jurel Seriola rivoliana y de robalos principalmente Centropomus viridis y C. medius. Se cuenta con experiencia en varias familias de peces marinos, Lutjanidae (pargos, Lutjanus peru, L. argentiventris y L. aratus), Serranidae (cabrillas Paralabrax maculatofacsiatus y Mycteroperca rosacea), Carangidae (jureles, S. lalandi y S. rivoliana) y Centropomidae (robalos, C. viridis y C. medius). Por supuesto en colaboración con otros especialistas del centro y de otras instituciones, en temas de fisiología, genética y patología, para resolver problemas presentes en la incipiente industria de la Maricultura.

Se han obtenido desoves tanto naturales por medio del control de su ciclo biológico con el manejo de temperatura y fotoperiodo y con técnicas de inducción con hormonas. Hemos contado con convenios de colaboración con empresas en el cultivo de huachiangos (Lutjanus peru), Totoaba (Totoaba macdonaldi) y Jurel (Seriola lalandi y Seriola rivoliana), las cuales cuentan con producción comercial. Actualmente para el desarrollo de la tecnología del robalo con fines a pequeños productores, agrícolas y pesqueros, para sistemas de acuaponia, estanques y jaulas; en mar, ríos o lagos. Contamos con infraestructura con sistemas para el manejo de reproductores, producción de alimento vivo y cultivo larvario, además de sistema para el desarrollo de experimentos en juveniles y larvas.