El noroeste de México es la región pesquera más importante del país, tanto en volúmenes de captura como en generación de riqueza. El desarrollo de este sector ha estado acompañado de problemas internos, como el sobredimensionamiento de las flotas, conflictos sociales por acceso a recursos, sobreexplotación y bajo rendimiento económico, que se combinan con factores externos como son la creciente demanda de certificación de sustentabilidad para las exportaciones de productos del mar y las diversas formas de cambio ambiental. En atención a esta problemática, la línea tiene como misión investigar la biología básica de los organismos que se capturan, la dinámica de los ambientes donde habitan y los diferentes componentes del sistema pesquero, desde la captura y el manejo hasta la modelación bioeconómica, para contribuir con información técnica robusta, tanto a la toma de decisiones por parte de la autoridad pesquera, como a la planeación de la inversión y las estrategias de desarrollo del sector productivo.